Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KATNB1Q9BVA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNB1Q9BVA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KATNB1Q9BVA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms