Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf50Q9BV19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf50Q9BV19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf50Q9BV19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf50Q9BV19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms