Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9BRP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9BRP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9BRP9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9BRP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9BRP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9BRP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9BRP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9BRP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9BRP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9BRP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9BRP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9BRP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9BRP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9BRP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9BRP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9BRP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9BRP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9BRP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9BRP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9BRP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9BRP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9BRP9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9BRP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9BRP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9BRP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9BRP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9BRP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9BRP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9BRP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9BRP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9BRP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9BRP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9BRP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9BRP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms