Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOPXQ9BPY8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOPXQ9BPY8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOPXQ9BPY8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms