Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim3Q99PE5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim3Q99PE5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim3Q99PE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms