Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtn4Q99P72 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtn4Q99P72 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtn4Q99P72 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Rtn4Q99P72 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms