Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab27bQ99P58 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms