Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl43Q99N89 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl43Q99N89 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl43Q99N89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms