Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mccc1Q99MR8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mccc1Q99MR8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mccc1Q99MR8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms