Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SrrtQ99MR6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrrtQ99MR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrrtQ99MR6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrrtQ99MR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrrtQ99MR6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms