Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ9

Ddx50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx50Q99MJ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx50Q99MJ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx50Q99MJ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx50Q99MJ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx50Q99MJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx50Q99MJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx50Q99MJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx50Q99MJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx50Q99MJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx50Q99MJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx50Q99MJ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms