Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME7

Tbx19, T-box transcription factor TBX19, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx19Q99ME7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tbx19Q99ME7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tbx19Q99ME7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tbx19Q99ME7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbx19Q99ME7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbx19Q99ME7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbx19Q99ME7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.5 ms