Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RtcbQ99LF4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RtcbQ99LF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RtcbQ99LF4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RtcbQ99LF4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RtcbQ99LF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms