Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SmagpQ99KC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmagpQ99KC7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmagpQ99KC7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms