Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Higd1bQ99JY6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1bQ99JY6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1bQ99JY6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms