Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxf1Q99JX7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nxf1Q99JX7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nxf1Q99JX7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nxf1Q99JX7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nxf1Q99JX7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms