Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim11aQ99J19 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim11aQ99J19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim11aQ99J19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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