Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
YME1L1Q96TA2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YME1L1Q96TA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
YME1L1Q96TA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YME1L1Q96TA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YME1L1Q96TA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms