Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARXQ96QS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARXQ96QS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARXQ96QS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms