Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA13Q96PP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSGA13Q96PP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSGA13Q96PP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSGA13Q96PP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms