Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIM3Q96PE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ZIM3Q96PE6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIM3Q96PE6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZIM3Q96PE6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms