Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf49Q96NF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf49Q96NF6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C8orf49Q96NF6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C8orf49Q96NF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms