Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL1Q96MI9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL1Q96MI9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AGBL1Q96MI9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL1Q96MI9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AGBL1Q96MI9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL1Q96MI9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL1Q96MI9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL1Q96MI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms