Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNBD2Q96M20 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD2Q96M20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD2Q96M20 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms