Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00615Q96LM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00615Q96LM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00615Q96LM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00615Q96LM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00615Q96LM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00615Q96LM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00615Q96LM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00615Q96LM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms