Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM47Q96LD4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM47Q96LD4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM47Q96LD4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms