Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00208Q96KT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms