Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDLIM2Q96JY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PDLIM2Q96JY6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDLIM2Q96JY6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms