Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC136Q96JN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC136Q96JN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC136Q96JN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC136Q96JN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC136Q96JN2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms