Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
JPH4Q96JJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.56■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
JPH4Q96JJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
JPH4Q96JJ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
JPH4Q96JJ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
JPH4Q96JJ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
JPH4Q96JJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
JPH4Q96JJ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
JPH4Q96JJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms