Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPIP1Q96JH7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPIP1Q96JH7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
VCPIP1Q96JH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms