Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46AQ96IP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46AQ96IP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46AQ96IP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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