Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
BCANQ96GW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
BCANQ96GW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BCANQ96GW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms