Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMIM12Q96EX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM12Q96EX1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms