Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG4CQ96DT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG4CQ96DT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATG4CQ96DT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms