Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf43Q96C57 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C12orf43Q96C57 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf43Q96C57 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms