Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APH1AQ96BI3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APH1AQ96BI3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1AQ96BI3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1AQ96BI3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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