Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS33AQ96AX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS33AQ96AX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS33AQ96AX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33AQ96AX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms