Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC59Q96AG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
LRRC59Q96AG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC59Q96AG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC59Q96AG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC59Q96AG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms