Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARVELD3Q96A59 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms