Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A4Q969I6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A4Q969I6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A4Q969I6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms