Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCE1Q969G3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCE1Q969G3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCE1Q969G3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms