Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKD2Q969F2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKD2Q969F2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKD2Q969F2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKD2Q969F2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms