Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS1Q92902 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS1Q92902 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS1Q92902 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS1Q92902 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPS1Q92902 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS1Q92902 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS1Q92902 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS1Q92902 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms