Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC2Q92769 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC2Q92769 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC2Q92769 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms