Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOPBP1Q92547 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TOPBP1Q92547 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOPBP1Q92547 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOPBP1Q92547 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TOPBP1Q92547 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms