Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCSTNQ92542 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCSTNQ92542 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCSTNQ92542 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms