Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tom1l1Q923U0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1l1Q923U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1l1Q923U0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1l1Q923U0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms