Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Clip1Q922J3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Clip1Q922J3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Clip1Q922J3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Clip1Q922J3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Clip1Q922J3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Clip1Q922J3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms