Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mthfd1Q922D8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mthfd1Q922D8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mthfd1Q922D8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms